• макс. диск: 64Тб
• полная поддержка транзакций (4 уровня изоляции)
• блокировка записи/строк (не таблицы), два вида блокировок (SHARED, EXCLUSIVE)
• полнотекстовый индекс: нет
• безопасная для транзакций
• индексы кластеризуются для «типичных запросов»
• поддержка целостности (внешние ключи)
• может использоваться на ОС с ограниченным размером файла
• множество настроек для оптимизации
• позволяет использовать Raw Disk для таблиц в обход ФС
• по умолчанию включен AUTOCOMMIT (SET autocommit=1)
• автоматически детектит дэдлоки (deadlocks)

Движок был разработан специально для больших таблиц. Разработчики заявляют, что InnoDB — самый быстрый из всех известных движков для БД основанных на дисках (множественные тесты это подтверждают)

• SELECT COUNT(*) FROM table работает гораздо медленнее, чем MyISAM — создавайте триггеры если нужно (COUNT, SUM, AVG, etc)
• бэкап простым копирование файлов невозможен
• mysqldump работает медленно, для бэкапа используйте InnodDb Hot Backup
• следите за индексами, выгода InnoDB теряется, если для запросов нет индексов

Рекомендации: высоконагруженные сайты, финансовые транзакции

• ibdata1: By default all data and indexes for all tables/databases is stored in a single, shared file: ibdata1. idbata1 does not shrink. If rows are deleted, space will be reclaimed by new rows, but the file will only grow in size.
• ib_logfile0 and ib_logfile1: Redo log files to recover lost data if MySQL is not shutdown properly.
• tablename.frm: Each table has a small *.frm file in the database-specific directory which stores the table definition.