set HOME=/var/www/nginx-sites/your-site.com/httpdocs && php /usr/share/php/drush/drush.php importkit-update
Где в переменную HOME необходимо поместить прямой путь до вашего сайта
Окончательный вариант записи в crontab выглядит: nano /etc/crontab
# /etc/crontab: system-wide crontab # Unlike any other crontab you don't have to run the `crontab' # command to install the new version when you edit this file # and files in /etc/cron.d. These files also have username fields, # that none of the other crontabs do. SHELL=/bin/sh PATH=/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin # m h d m w user command */30 * * * * www-data set HOME=/var/www/nginx-sites/your-site.com/httpdocs && php /usr/share/php/drush/drush.php importkit-update
Запуск будет производиться каждые 30 минут, и скрипт будет запускаться от пользователя www-data