Версия OS

Debian

uname -a

lsb_release -a

cat /etc/issue

cat /proc/version

cat /etc/debian_version

Остальные

Тип ФС - fdisk [-l] //freebsd or not freebsd(может конечно быть и solaris=)) - ufs или ext3 ;Или - /dev/hda , /dev/hdb - linux , /dev/ad0s3e(нечто в этом роде) - freebsd
Посмотреть логи - /var/log/daemon.log,/var/bootstrap.log(linux) , /boot/loader.rc(freebsd) ,заглянуть в /boot/grub/menu.lst
Содержимое /usr/src/[kernel sources](если они конечно есть=)) , а точнее README.[OS](linux) or README(freebsd)
echo 'int main(void){return 0;}' > os.c && gcc os.c -o os && strings os
Если стоит freebsd, то увидете нечто вроде
$FreeBSD: src/lib/csu/i386-elf/crti.S,v 1.7 2005/05/19 07:31:06 dfr Exp $
По типу установки пакетов.
Присутствие директорий

/usr/ports - freebsd
/etc/apt - debian\ubuntu
/usr/portage - gentoo

откликается на rpm - redhat based , на deb или apt-get - debian\ubuntu , на emerge - gentoo , pacman - arch linux , slapt-get, swaret , slackpkg - slackware

Специфические файлы - /etc/rc.conf - freebsd\gentoo для остальных linux`ов rc.local,также можно посмотреть содержимое данного файла(к примеру, настройка маршрутиризации в debian`е и freebsd отличается по синтаксисиу ip) ; /etc/master.shadow - freebsd ,/etc/redhat-release - redhat or fedora , /etc/debconf.conf or /etc/debian_version - debian\ubuntu , /etc/freebsd-update.conf - freebsd , /COPYRIGHT(freebsd), позаглядывать в файлы /etc многие из них могут начинаться на
# $FreeBSD: ...
В /usr/share/doc тоже можно много интересного найти - /handbook(freebsd) или /ubuntu-doc

Если стоит web-сервак, то можно посмотреть какой message выводит сервер(но способ крайне ненадёжный) telnet localhost 80 ; GET /123123123123123123.html - <address>Apache/2.0.55 (Ubuntu) PHP/5.1.6 Server at 127.0.1.1 Port 80</address>

dmesg | grep Linux

Часто применяемые команды

Скрипты инициализации

Runit

Резервное копирование

rsync

Сетевые

netstat

Shell

bash - настройки среды, скрипты

less

tar

ps

du

locate

find

grep

chmod

sed

awk

mke2fs

fsck

sudo - настройки

БД

mysql